府谷县古生物化石博物馆于1996年设立，与府谷县文旅中心一套人马两块牌子。博物馆管理、维护、运行方面的经费，县财政没有独立预算。博物馆自设立以来，吸引了大量游客，年参观人数稳定增长。

2004年被榆林市委、市政府命名为爱国主义教育基地，成为一张真正的地方文化名片。

为加强公民思想道德建设，充分发挥博物馆宣传先进文化的重要作用，该馆于2010年开始向全社会免费开放。