药王山博物馆石刻有摩崖造像、题字，石牌坊，历代累朝各种碑石碣刻，石刻各类艺术品等。其存藏各种碑石计三百五十余通，以北魏至唐代百余通造像碑与宋至明清药王类石碑弥足珍贵，尤以北魏造像碑最为精采，其数量多，年代久，品位高，知名海内外，它是中国石刻艺术中一颗璀璨的明珠。

2020年，药王山博物馆入选“第四批国家二级博物馆名单”。